兴国中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力是不同的。虽然中等专业学校培养学生专业技能，但是毕业证书的认可度和适用范围通常不同于普通高中。普通高中毕业证书更广泛地适用于高等教育和就业市场。因此，兴国中等专业学校毕业证书的效力需要根据具体情况进行评估，可能无法与普通高中毕业证书完全等同。